I know my way is kinda childish.
Isso é discutível. Se for realmente necessário mostrar explicitamente que um nó foi excluído, então (IMO) um simples canto a canto é uma maneira razoável de fazê-lo. Eu vi esse tipo de notação usada em livros de texto.
O ponto principal é que levar a informação ao leitor claramente é mais importante que "infantil" versus "profissional".
I am wondering how to present them professionally.
Suponho que você possa sobrepô-lo com "Excluído" em um estilo de texto distinto.